Um novo tipo de estratégia de teste COVID-19 pode ajudar a agilizar o processo de identificação de casos, rastreamento de variantes e detecção de vírus coinfetantes.
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| Nirvana : teste para coronavírus |
Atualmente, ensaios separados e fluxos de trabalho complexos estão envolvidos em cada um desses três procedimentos diagnósticos, com análises normalmente realizadas em instalações altamente especializadas.
Os pesquisadores da KAUST agora combinaram todos os três tipos de testes em um único procedimento que deve permitir o rastreamento do ponto de atendimento do COVID-19 e as muitas variantes emergentes do SARS-CoV-2.
"Nosso teste tudo-em-um oferece uma solução integrada promissora para detecção rápida e implantável em campo e vigilância mutacional de vírus pandêmicos", disse o biólogo de células-tronco Mo Li, que liderou o estudo.
O teste envolve um minilaboratório do tamanho de uma maleta portátil que evita todas as técnicas lentas e caras que são padrão para a triagem e monitoramento do COVID-19.
O novo teste tira proveito de um método genético recente (chamado amplificação de polimerase de recombinase) e um sequenciador portátil de última geração para detectar rapidamente a presença de sequências virais e fornecer leituras - em até 96 amostras de pacientes por vez.
- A equipe de Li, em colaboração com pesquisadores da Arábia Saudita, Estados Unidos e Espanha, projetou o teste para decodificar cinco segmentos do genoma SARS-CoV-2, cada um escolhido para ajudar a guiar o rastreamento de variantes.
- Eles também incorporaram ensaios para três vírus respiratórios comuns que podem causar sintomas semelhantes ao COVID-19.
Trabalhando com colaboradores clínicos de hospitais em Meca, Medina e Jeddah, a equipe validou a técnica - denominada NIRVANA - usando swabs de nariz e garganta de pessoas com suspeita de infecções por SARS-CoV-2.
Eles também testaram amostras de águas residuais coletadas de esgoto municipal em KAUST para mostrar como o método poderia permitir a vigilância em nível de população de SARS-CoV-2 e outros vírus.
"O NIRVANA pode diagnosticar rapidamente várias infecções virais de uma maneira de alto rendimento", observa Chongwei Bi, um Ph.D. estudante no laboratório de Li. Além do mais, quando se trata de monitoramento do SARS-CoV-2, "ele pode detectar o vírus simultaneamente e relatar suas mutações", acrescenta.
Com o apoio da Equipe de Resposta de Pesquisa Rápida (parte da Iniciativa de Saúde Inteligente da universidade), Li e seu grupo de laboratório continuam a refinar a plataforma NIRVANA para implantação em larga escala.
Uma limitação do teste é que ele só pode detectar mutações SARS-CoV-2 em regiões genômicas selecionadas e, como novas variantes de preocupação continuam surgindo em todo o mundo, essas regiões podem precisar ser atualizadas para refletir a natureza em evolução do vírus .
“Ao mesmo tempo”, disse Li, “estamos buscando colaborar com hospitais para testar o NIRVANA na clínica”.
Referência: Bi C, Ramos-Mandujano G, Tian Y, et al. Detecção simultânea e vigilância de mutação de SARS-CoV-2 e co-infecções de vários vírus respiratórios por sequenciamento rápido implantável em campo.
