Por Dasantila Golemi-Kotra
Professor, Biologia, York University, Canadá
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| coronavírus |
Omicron , a primeira variante de Covid-19 a ser elevada a variante de preocupação (VP) pela Organização Mundial de Saúde (OMS) em apenas alguns dias , apareceu no radar do laboratório Lancet em 8 de novembro na África do Sul , embora haja suspeita que já estava em circulação há algum tempo.
Graças ao seu excelente sistema de vigilância genômica , as autoridades de saúde sul-africanas relataram sua presença desde o início. Ao contrário de outras variantes, o Omicron pode ser detectado usando um teste de PCR sem exigir o sequenciamento do genoma completo, permitindo que sua disseminação seja seguida rapidamente.
Em 23 de novembro, 1.100 casos da variante (73% de todos os casos positivos) foram detectados na província de Gauteng, na África do Sul, em comparação com 10 casos registrados no início de novembro. Em 3 de dezembro , a Omicron oficialmente ultrapassou a variante Delta no país.
A taxa de reprodução efetiva (o número de pessoas infectadas por um único indivíduo) para Omicron é estimada em mais de seis , enquanto que para Delta foi estimada em cerca de cinco e que para uma doença altamente contagiosa como a varicela é nova.
Para onde a Omicron se espalhou?
A variante Omicron é confirmada em todos os continentes, exceto na Antártica . Os casos relatados fora da África do Sul até agora parecem estar relacionados principalmente a viagens e envolvem principalmente pessoas que foram vacinadas. No entanto, já temíamos uma propagação da comunidade .
Projeções de muitos países prevêem que os casos da Omicron logo ultrapassarão os da Delta . O Diretor Médico de Saúde de Ontário informou em 12 de dezembro que os casos de Omicron representam 10% de todos os casos positivos na província, confirmando que a variante é altamente transmissível, mesmo com um nível de atividade reduzido. Social (75% dos níveis pré-pandêmicos )
Como o Omicron é diferente de outras variantes?
As variantes aparecem como resultado de alterações ou erros, chamados de mutações, na sequência do genoma do vírus (o conjunto de instruções genéticas para o vírus).
A variante Omicron tem muito mais mutações do que as outras variantes em seu gene S - este codifica a proteína spike do vírus, que é a chave que permite ao vírus acessar nossas células. Omicron acumulou 50 mutações, 32 dos quais são no gene S . Em comparação, a variante Alfa tem 9 em seu gene S, e o Delta , 9 a 13.
Os dois últimos são mais transmissíveis do que a versão original, 50% e 100% respectivamente, e comprometem em alguma medida a proteção oferecida pela vacina.
Omicron difere de outras variantes no número de mutações em sua proteína spike. (Pixabay)
É muito cedo para entender completamente a variante Omicron. Como as proteínas são compostas por cadeias de aminoácidos, as mutações no gene S resultam em substituições de aminoácidos que causam alterações na proteína do pico. O número de substituições de aminoácidos na proteína S de Omicron, e a sobreposição com aquelas vistas em outras variantes de interesse (VP) e variantes de interesse (VI), fazem sua proteína de pico parecer sobrecarregada.
A proteína de pico Omicron tem seis substituições de aminoácidos únicas que não foram observadas em outro VP, sete presentes em um ou mais VP, três que aparecem em todos os VP atuais e outras substituições estão muito menos presentes nas outras variantes. As três substituições comuns a todos os VPs estão associadas ao escape imunológico e ao aumento da transmissibilidade e capacidade de infecção.
O Omicron é uma "supervariante"?
Como cientista, fico perplexo com essa variante. Como sua proteína de pico poderia acumular 32 substituições de aminoácidos no que parece ser um período de tempo muito curto e encaixar tantas substituições em uma única proteína? Essa proteína se tornou a chave perfeita para acessar nossas células e, ao mesmo tempo, se esconder de nossos anticorpos? O Omicron causa infecções mais graves?
Não será fácil entender quando e como o Omicron evoluiu, mas as mutações que adquiriu certamente deixarão os cientistas maravilhados .
O número de substituições de aminoácidos em sua proteína de pico é considerável. As proteínas são bastante flexíveis em sua capacidade de aceitar essas substituições, o que as torna mais eficazes. Mas muitas vezes isso acontece em detrimento do micróbio (vírus, neste caso), pois as substituições requerem energia e recursos.
Primeiro, para cada mutação útil, uma mutação compensatória deve ocorrer no gene para que a estrutura da proteína permaneça intacta.
Em segundo lugar, a existência de um número tão grande de mutações no gene S exigiria modificações na máquina de replicação do vírus para permitir tantos erros. No entanto, essas modificações podem ter consequências prejudiciais na replicação do vírus.
Finalmente, o vírus depende dos recursos do hospedeiro para produzir suas proteínas, como certas moléculas de RNA do hospedeiro (RNA de transferência) e aminoácidos. Esses recursos, e outros, podem não atender à demanda do vírus e causar seu mau funcionamento. Em outras palavras, o vírus mutante pode ter um problema de oferta e demanda.
Assim, um gene S "supermutado" provavelmente compromete o valor adaptativo geral do vírus; outro elemento deve, portanto, ser menos eficiente para permitir a produção de um gene S supermutado. Essa perda de aptidão é normal no mundo microbiano. Por exemplo, a resistência das bactérias aos antimicrobianos é causada pelo uso de antibióticos. No entanto, na ausência deles, as bactérias geralmente perdem essa resistência porque é caro em energia.
Isso sugere que o Omicron pode ser mais transmissível (como mostram os dados atuais ) do que o Delta, enquanto causa infecção menos grave. Os dados da África do Sul e casos identificados em todo o mundo sugerem que OMICRON não foi associado a doenças graves e morte.
As vacinas e a imunidade pós-infecção protegem contra o Omicron?
As vacinas atuais foram projetadas para proteger contra a infecção com Covid-19, ou seja, para prevenir a hospitalização e a morte. No entanto, oferecem mais, pois permitem uma redução de infecções de até 80% (para vacinas de mRNA) e retardam a transmissão .
Não se sabe se a variante Omicron pode escapar da imunidade, seja induzida por infecção natural ou por vacina. No entanto, um estudo que ainda não foi revisado por pares mostra que a taxa de reinfecção com Omicron é muito maior do que a registrada durante as ondas Beta e Delta na África do Sul.
Este relatório sugere que a imunidade adquirida por infecções com variantes Beta ou Delta pode não proteger contra Omicron. Essa descoberta poderia explicar o rápido aumento de casos de Omicron na África do Sul, onde grande parte da população foi infectada durante ondas das variantes Alfa, Beta e Delta.
Não há dados suficientes para tirar uma conclusão sobre a proteção oferecida pela imunidade da vacina contra o Omicron. A taxa de vacinação na África do Sul gira em torno de 25%. Casos de infecções pós-imunização com a variante Omicron em todo o mundo sugerem que essa variante pode contornar as vacinas no que diz respeito à infecção.
Uma infecção pode ser assintomática ou leve. As vacinas têm grande probabilidade de proteger contra as formas graves de Covid-19, como indicam relatórios recentes (ainda não revisados por pares) da África do Sul.
À luz dos inúmeros relatos de enfraquecimento dos anticorpos neutralizantes induzidos pela vacina (ou por infecção natural) ao longo do tempo, muitos países, incluindo o Canadá , estão se precipitando para administrar doses de reforço e aumentar a cobertura vacinal a fim de proteger sua população contra um possível ressurgimento da doença.
Tanto os estudos clínicos como os dados reais demonstraram que as doses de reforço protegem contra infecções e doenças graves. Um relatório recente da Pfizer mostra que a administração de uma terceira dose pode alterar a trajetória de transmissão do Omicron.
O que acontecerá com a Omicron em um futuro próximo?
Muitos laboratórios em todo o mundo estão atualmente avaliando o Omicron quanto à sua transmissibilidade, virulência, gravidade da doença que causa e capacidade de escapar da proteção da vacina. Por enquanto, podemos apenas esperar pelos resultados.
Aqui no Canadá, devemos continuar a aumentar a cobertura de vacinação para 90% ou mais para a população elegível. As vacinas funcionam !
A aprovação de vacinas para crianças de cinco a onze anos sem dúvida aumentará ainda mais a cobertura vacinal e mudará a trajetória de transmissão do Omicron.
Ao mesmo tempo, devemos manter medidas sanitárias: coberturas faciais ( dados reais mostram que reduzem a propagação do vírus em 53%), distanciamento (Covid-19 é uma doença transmitida do ar ), higienização das mãos e redução de grandes reuniões, especialmente dentro de casa.
Por fim, e igualmente importante, o surgimento da variante Omicron nos lembra, mais uma vez, o quanto é fundamental ajudar os países em desenvolvimento em suas campanhas de vacinação. O vírus continuará a minar o progresso que os países ricos estão fazendo com a vacinação, desde que encontre um terreno fértil para evoluir em algum lugar do mundo.
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