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Ana S Gonzalez-Reiche
O início da pandemia de COVID-19 acelerou a implementação da vigilância genômica de seu agente causal, SARS-CoV-2, em escala global. Em 6 de abril de 2023, havia mais de 15 milhões de sequências genômicas de SARS-CoV-2 depositadas no banco de dados da Global Initiative on Sharing Avian Influenza Data e 6,8 milhões de sequências no GenBank, os dois maiores bancos de dados de sequências de vírus. Apesar desse esforço sem precedentes, existe um desequilíbrio pronunciado na extensão dos dados genômicos do SARS-CoV-2 de países de alta e baixa renda.1Os países africanos estão especialmente sub-representados, respondendo por menos de 1% das sequências globais de SARS-CoV-2 durante o período de 3 anos da pandemia (de 6 de março de 2020 a 6 de abril de 2023), com representação geográfica escassa em todo o continente.2A vigilância genômica na África do Sul provou ser crucial na identificação precoce das variantes beta (B.1.351) e ômicron (B.1.1.529), que mais tarde se espalharam pelo mundo.3Os estudos que caracterizam a diversidade do SARS-CoV-2 na África preencheram importantes lacunas de conhecimento sobre a dinâmica local e global da pandemia.
No Lancet Global Health , Francisco José Martínez-Martínez e colegas5realizou um estudo retrospectivo para analisar as introduções das variantes beta e delta (B.1.617.2) de preocupação que circularam em Moçambique durante o ano de 2021. Com uma abordagem abrangente envolvendo análise comparativa em larga escala da diversidade do vírus em Moçambique e a mais extensa coleção de sequências globais de vírus colocadas em uma árvore filogenética, eles foram capazes de identificar vírus intimamente relacionados de outras regiões geográficas que potencialmente originaram a população local de vírus. Reconhecendo a lacuna na vigilância genômica em todo o continente africano, os autores enfatizam ainda mais um dos principais desafios de rastrear a dinâmica da pandemia ao inferir eventos de transmissão regional e local. Eles mostram que, mesmo ao usar uma análise em escala pandêmica,
As descobertas de epidemiologia molecular de Martínez-Martínez e colegas foram obtidas a partir da análise de cerca de 700 genomas de SARS-CoV-2 e mostraram que o fechamento de fronteiras durante as ondas beta e delta reduziu o número de introduções de locais internacionais distantes, mas não impediu a importação de o vírus para Moçambique dos países vizinhos. A partir desses dados, os autores questionam a eficácia do fechamento de fronteiras durante emergências de saúde pública e a justificativa de aplicar tais medidas com implicações sociais e econômicas consideráveis. Muitos países seguiram essa abordagem, mas a contribuição das restrições seletivas de viagens para reduzir as importações virais e diminuir a carga no sistema de saúde, e o impacto geral na magnitude da epidemia permanecem desconhecidos e difíceis de quantificar.6, 7ressalta a necessidade de modelar e compreender a dinâmica de disseminação dos vírus respiratórios pandêmicos em um mundo cada vez mais globalizado. O impacto econômico e social de mudanças repentinas nas políticas de migração internacional não pode ser subestimado, tornando-se uma questão central a ser abordada para melhorar nossa preparação para futuras pandemias.
A necessidade de analisar e interpretar a grande quantidade de dados de sequenciamento quase em tempo real durante a crise pandêmica levou o campo da filogenética a desenvolver novos métodos que explicam os dados ausentes e que escalam de maneira computacionalmente eficiente para conjuntos de dados muito grandes .8, 9Desde o surgimento de variantes iniciais de SARS-CoV-2 de interesse e preocupação, testemunhamos repetidamente como a disseminação e o estabelecimento de novas e distintas linhagens genéticas podem afetar negativamente a eficácia da vacinação e a robustez da imunidade da população.10Consequentemente, a vigilância genômica viral contínua para detectar novas variantes emergentes em todos os cantos do mundo permanece imperativa. Em muitos países, o sequenciamento viral de rotina para vigilância genômica do SARS-CoV-2 e outros patógenos sazonais e emergentes já diminuiu e o futuro desses esforços é incerto. Esse problema aumenta a probabilidade de ser pego de surpresa pela circulação enigmática de diversidade desconhecida de vírus, atrasando a implantação de contramedidas adequadas, caso surja uma variante nova e imunoevasiva do SARS-CoV-
Com Agências
https://www.thelancet.com/action/showPdf?pii=S2214-109X%2823%2900197-3
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